L’étude des tumeurs par la technique de « biopuces » ou « DNA-array » permet d’obtenir le profil instantané du niveau d’expression de plusieurs centaines de gènes. Afin de tester l’intérêt de cette technique dans le diagnostic des lymphomes, nous avons analysé 17 biopsies ganglionnaires à l’aide d’une membrane de type « macro-array » contenant 217 gènes impliqués dans l’apoptose ou le cycle cellulaire. Huit échantillons correspondaient à des cellules lymphoïdes triées par billes magnétiques : cellules B de 2 lymphomes folliculaires (LF) et de 2 lymphomes B diffus à grandes cellules (LDGC), cellules B et cellules T de 2 adénites, cellules B vierges de phénotype CD19+/CD38-/IgD+ et cellules B des centres germinatifs de phénotype CD19+/CD38+/IgD- de 2 amygdales bénignes. Neuf échantillons étaient des fragments tissulaires entiers correspondant histologiquement à 4 LF, 2 LDGC et 3 adénites. Dans le groupe des cellules triées, les profils d’expression étaient statistiquement corrélés à la nature des échantillons, permettant de séparer les LF, les LBGC, et les échantillons bénins. Les corrélations étaient moins nettes dans le groupe des tissus. Pour vérifier la fiabilité de la technique de biopuce, nous avons analysé en parallèle par immunohistochimie (IHC) l’expression des caspases -2, -3, -8, -7 et -9. Les résultats des deux méthodes montraient une bonne corrélation. Ces résultats suggèrent une application possible des biopuces pour le diagnostic des lymphomes malins.
Microarray technology has recently led to the identification of molecular prognostic subgroups in non Hodgkin’s lymphomas. In order to determine the usefulness of ready-made macroarrays as routine diagnosis tools in haemato-pathology, we have analysed lymph node biopsies using a cDNA macroarray containing genes involved in apoptosis, including caspases. Nine biopsy specimens were analysed on total frozen tissues : 4 samples of B-cell follicular lymphoma (FL), two of B-cell diffuse large cell lymphoma (DLCL), and three of non-neoplastic lymph nodes from benign lymphadenitis. Eight cell populations were sorted from fresh tissues : malignant B-cells from 2 FL cases and 2 DLCL cases, reactive B-cells from 1 benign lymph nodes, reactive T-cells from 1 benign lymph node, virgin (mantle zone) B-cells and germinal center (GC) B-cells from benign tonsils. Immunohistochemistry (IHC) on paraffin sections was performed for localization of caspases 2, 3, 4, 7, 8, and 9. In the clustered array data, sorted cells from samples sharing common histological lesions grouped together, whereas the array/histology correlation was less satisfactory for tissues. The expression profiles of both array and IHC methods were correlated for most caspases and samples. Variations in array profiles of sorted cell populations can be statistically associated with specific histological features, suggesting a possible diagnostic application of ready-made « Apoptosis macroarrays » in haematopathology.