Table 2

Genotype-phenotype correlations

Patient No		Onset (mean or range)		Sex		Clinical phenotype		Mutation	% mutant (mean)		Conservation				Morphology			RC deficiency		Family history	Haplogroup affiliation according to ref 21
Patient No		Onset (mean or range)		F	M	Clinical phenotype		Mutation	% mutant (mean)		nt	W-C bp			RRF	CCO⁻		CI	CIII	Family history	Haplogroup affiliation according to ref 21	CIV
(A) Genotype-phenotype correlation in 65 patients with known pathogenic mtDNA mutations
Deletions (n=28)																						57%: D^C; 21%: 4216;
																						11%: 12308; 7%:
																						12705; 4%: 15904
1–9	15 y	8	1	KSS	del	60	∼	∼	+	+		+	+	+	s
10–23	23 y	7	7	CPEO	del	60	∼	∼	+	+		+	+	+	s
24	25 y	1	0	CPEO	dels	20	∼	∼	+	+		+	+	+	f
25	2 d	0	1	Pearson	del	60	∼	∼	+	+		++	++	++	s
26	40 y	0	1	MM	del	50	∼	∼	+	+		+	+	++	s
27	42 y	0	1	MM	dels	40	∼	∼	+	+		++	+	++	s
28	20 y	1	0	MNGIE	dels	30	∼	∼	−	−		+	−	+	f
Known pathogenic tRNA mutations
									tRNA^Leu(UUR)(n=23)																For 3243 (n=22):
																									50%: 4216; 27%:
																									D^C: 27%; 14%:
																									12308; 9%: 12705
29–42	12 y	4	10	MELAS	A3243G	62	+	∼	+	+		++	−	+	1s 13f
43	27 y	0	1	CPEO	A3243G	50			+			++	−	−	f
44–46	29 y	1	2	Diab/Df	A3243G	28			−	−		+	−	−	f
47	40 y	0	1	Diab/MM	A3243G	65			+	+		++	−	−	s
48–50	28 y	1	2	MM	A3243G	80			+	+		++	−	−	?
51	?	0	1	MELAS	T3271C	45	−	+	+	+		+	−	−	?	−
					tRNA^Ser(UCN)
52–54	2 y–8 y	2	1	PME/Df	7472insC	100	+	+	−	−		−	−	++	1s 2f	Variable27
55–56	5 mth–14 y	1	1	PME/Df	T7512C	100	+	+	−	−		+	−	++	1s 1f	Variable27
57–58	3 y–30 y	1	1	MM	G7497A	100	−	+	+	−		++	−	++	1s 1f	Variable27
					tRNA^Lys
59–61	11 y	1	2	MERRF	A8344G	60	+	∼	+	+		++	−	++	f	D^C: n=2; 4216: n=1
					tRNA^Phe
62	26 y	0	1	MM	T618C	95	−	+	+	+		++	+	−	f	−
					tRNA^Asp/Thr
63		1 y		0		1		MM, CMP	G5703A	100	−	+			+		+			−	−	+	s	−
63		1 y		0		1		MM, CMP	A15923G	100	+	∼			+		+			−	−	+	s	−
					tRNA^Cys
64	11 y	0	1	MEM/SSPEE	T5814C	100	+	+	−	−		−	−	+	f	−
					tRNA^Leu(CUN)
65	8 m	0	1	MEM/GA I	T12297C	100	+	∼	−	−		+	−	−	s	−
F	M	nt	W-C bp	RRF	CCO⁻	CI	CIII	CIV
(B) Genotype-phenotype correlations in 26 patients with novel mtDNA mutations
					tRNA^Phe												D^C+ 12308
66–67	20 y	1	1	MM	T629C	100	−	∼	+	+		−	−	+	s	NA
14	23 y	1	0	CPEO	A644G	100	+	+							s	+	−
					tRNA^Leu(UUR)
68	11 y	0	1	ATX, SHL, MM, RP	A3274G	40	−	−	+	+		++	−	−	s	−	−
					tRNA^Met
69–70	20 y	2	0	MM	T4418C	100	−	∼	+	+		+	−	−	s	NA	D^C+ 4216
																	12308var
71	45 y	1	0	CPEO	A4435G	13	+	∼	−	−		−	−	+	s	+	−
72	8 y	0	1	CPEO	T4452C	100	+	∼	−	−		−	−	+	s	NA	−
73	8 y	0	1	MM	T4454C	100	−	∼	−	−		−	−	+	s	NA	−
					tRNA^Trp
72					T5553C	100	−	−
					tRNA^Asn
74	10 y	1	0	MM	A5715G	100	−	∼	−	−		+	−	−	s	NA	−
					tRNA^Cys
75	6 y	1	0	ATX, SHL,	G5773A	100	−	∼	−	−		+	−	−	s	+	D^C
				RP, Df
76	34 y	0	1	MM	G5773A	100			−	+		++	−	++	s	NA	D^C
					tRNA^Tyr
77	Birth	0	1	Cong LA	C5839T	100	−	∼	−	−		+	−	+	s	+	−
78	Birth	1	0	Cong LA	A5843G	100	−	∼	−	−		−	−	+	s	−	−
					tRNA^Ser(UCN)
79	Birth	1	0	MEM	A7500G	100	+	∼	−	−		−	(+)	+	s	NA	−
					tRNA^Lys
80–81	Birth	1	2	MEM, MH	A8343G	100	−	∼	−	+		++	++	++	s	+	D^C
					tRNA^His
27					C12153T	100	−	∼								NA	−
82	34 y	1	0	MM	A12172G	100	−	∼	−	+		−	−	+	s	NA	−
					tRNA^Thr
83	Birth	0	1	Hepat	G15894A	100	−	+	−	+		−	−	+	s	NA	−
84	5 y	1	0	MEM	G15897A	100	−	−	−	+		−	−	++	s	+	D^C
85	34 y	1	0	MM	G15897A	100			−	+		+	−	+	s	NA	−
86	6 y	0	1	MEM	G15930A	100	−	∼	−	−		+	−	−	s	+	D^C
87	Birth	1	0	MM	G15930A	100			−	−		+	−	−	f	+	−
88	Birth	1	0	Hepat	G15930A	30			−	−		−	(+)	+	s	+	−
89–90	4–7 y	1	1	MEM	T15941C	100	−	∼	−	−		−	(+)	+	1s 1f	+	D^C + 12308
					tRNA^Pro
91	39 y	1	0	CPEO	T15968C	100	−	+	−	+		−	−	+	s	NA	−

F, female; M, male; %, % mutant mtDNA in skeletal muscle; conservation nt, W-C bp, conservation of the nucleotide and Watson-Crick base pair; RRF, ragged red fibres; CCO⁻, cytochrome c oxidase negative fibres; C, complex; haplogroup, haplogroup affiliation; ATX, ataxia; Hepat, hepatopathy; RP, retinopathy; SHL, sensorineural hearing loss; y, year; d, day; mth, months; del, single deletion; dels, multiple deletions; ∼, no relevance; +, high residual activity of 85–95% of the lowest reference range; ++, residual activity of 50–85% of the lowest reference range; +++, severe deficiency with residual activities of <50% when compared to the lowest reference range; s, single; f, familial; var, variable; id, identical; NA, not analysed. Patients 64 and 65 are typed in italics as our data did not confirm primary pathogenic influence of the tRNA mutations.